El objetivo global del proyecto consiste en documentar las alteraciones en procesos básicos del ecosistema que se derivan de la acumulación de productos aviarios y en evaluar las implicaciones que estas alteraciones tienen para la gestión y conservación del mismo. Este objetivo global puede desglosarse en los siguientes objetivos específicos:

1.- Cuantificar la presión aviaria en el ecosistema y su evolución temporal a distintas escalas.
2.- Evaluar las alteraciones biogeoquímicas y ecológicas inducidas por los productos aviarios en el suelo, su evolución espacio-temporal y su impacto en las biocenosis del suelo.
3.- Identificar las alteraciones biogeoquímicas inducidas por la influencia aviaria en los productores primarios, su evolución espacio-temporal y sus implicaciones ecológicas y ecofisiológicas.
4.- Modelizar la variabilidad espacio-temporal de la influencia aviaria en el ecosistema y establecer si existe una relación significativa entre la degradación del dosel arbóreo y la presión aviaria. En su caso, identificar los procesos responsables y evaluar las expectativas de supervivencia.