El objetivo fundamental del proyecto FLORA IBÉRICA DE ALGAS CONTINENTALES-II es la identificación y catalogación de las numerosas especies de algas macroscópicas que colonizan las aguas epicontinentales de la Península Ibérica. A partir de ahí se desarrollarán diferentes enfoques que permitiran profundizar en aspectos relacionados con su biología. Son de especial interés los estudios ultraestructurales- con microscopía electrónica- relativos a los caracteres taxonómicos; autoecología de las especies que permita su uso para la realización de los índices bióticos de macrófitos – aplicación de la directiva marco del agua-; análisis moleculares – secuencias de ADN y ARN - que faciliten el establecimiento de clasificaciones filogenéticas y relaciones evolutivas, etc. Desde el punto de vista teórico es de destacar que este biotipo ha aparecido independientemente varias veces a lo largo de la evolución en los organismos fotosintéticos (cianoprocariotas, cromoalveolados y plantas), por lo que su estudio puede abrir nuevas posibilidades para entender, de forma más adecuada, la evolución vegetal.